《绝密使命》第31、32集是大结局，剧情惊心动魄，让人泪奔。潘雨青一行护送洋大叔去苏区，要在永定的合溪过境。地下交通员丘老八子给他们送吃的，当向导。
曹瑞瑛带领特务，马大鋆带领一个连，早已将合溪围得水泄不通，张网以待。
丘老八子不认字，不会写自己的名字，让潘雨青教他写自己的名字。潘雨青将“丘老八子”写在他的右手手心，他舍不得擦去，然后下山去探听消息。他与潘雨青约定，以点火为信号，如果火光升起，就表明下山有危险。
丘老八子下山后，成功躲过了特务的盘查。回到家后，他准备出门点火，被特务拿枪逼了回去。形势非常危急，要是潘雨青等人带洋大叔下山，后果不堪设想。
在这种情况下，丘老八子冒着生命危险，将自己的房子点着了，然后一边往外跑，一边高声喊救火。狡猾的曹瑞瑛带领特务赶了过来，发现了丘老八子手心里的四个字，知道他在传递信号。
曹瑞瑛打了他一枪，丘老八子冲进火海壮烈牺牲。
潘雨青等人知道丘老八子出事了，个个眼里涌满泪水。为完成护送洋大叔的任务，潘雨青冒险下山去接头。
他刚进村就发现有特务盯梢，此时他已没有退路，只得去地下交通员家里接头。交通员告诉他，洋大叔等人只能从村西撤退，然后坐竹筏离开，江边有人接应。
潘雨青离开交通员的家，杀死了一个跟踪自己的特务，然后准备上山。这时他已经被特务包围了，不幸被捕。
曹瑞瑛残忍地将潘雨青的4根手指掰断了，然后将他绑在柱子上，准备等抓到洋大叔后再来处置潘雨青。
闽西交通大站站长李叔岩，知道潘雨青一行遇到的危险，带领几位交通员偷袭马大鋆的连队。他们边打边撤，成功将马大鋆和一个连引到了村东。
这时潘雨青以唱歌作为暗号，交通员在家里升起了伯公灯。邹叔宝等人看到信号后，带领洋大叔下山，然后顺利从村西突围，上了竹筏。
他们刚到达丁正昌号交通员的家里，曹瑞瑛就带领特务追来了。看到丁正昌号门口挂着斗笠，曹瑞瑛知道这就是交通员接头的地方。
交通员丁老板紧急带领邹叔宝一行人跳窗逃走，结果他被曹瑞瑛枪杀。
就在这时候，交通员李寿柱化装成79团的士兵，成功将潘雨青救走。
红军部队下山接应洋大叔，在村里与曹瑞瑛带领的特务交火，曹瑞瑛落荒而逃。抓捕洋大叔的失败，让曹瑞瑛几近崩溃。他决定将名单上几十位大埔、青溪的交通员及家眷全部抓获，以示报复。潘雨青已向李叔岩汇报，说叛徒余长庆出卖了大埔、青溪的地下交通员，必须通知他们赶紧撤离。
赖寿章去布庄接头寻找组织，意外发现叛徒余长庆出现了。原来曹瑞瑛让余长庆出来钓大鱼，余长庆发现了李叔岩，准备向曹瑞瑛报告。赖寿章一枪打死了余长庆，然后将特务引开，为交通员撤离赢取宝贵的时间。
在与特务的激战中，赖寿章在受伤的情况下，将民团首领张在林击毙。马大鋆带领连队赶来后，赖寿章承认了自己是共产党员，结果他被马大鋆枪杀。
黑子在曹瑞瑛的命令下，带领特务搜捕卢清泉等交通员，可他们早已撤离了。马大鋆带领一个连赶到青溪，搜捕潘雨青、余良廷等交通员，可他们也撤离了。结果大埔、青溪的交通员没有一人被抓。
巨大的失败面前，曹瑞瑛精神崩溃，一病不起，被送往上海治疗。3年后，曹瑞瑛再次回到汕头，与吕文超等特务一道抓捕彭庚年。可华富电料行早已人去楼空。
潘雨青、邹叔宝、余良廷等交通员赶到苏区，参加了红军。赖西诺已为邹叔宝诞下了一个儿子，她带着儿子坚守后方，继续支持丈夫的革命事业。
