《双世宠妃3》中墨言忱得知自己喜欢的曲檀儿早已落水溺死，伤心至极，回去质问曲媚儿，曲媚儿早就知道会有今天，她没有隐瞒，她向墨言忱坦白，为了墨言忱她什么都可以做，哪怕要自己去死。
她夺过墨言忱手中的刀便刺向自己，被墨言忱制止，俩人在争夺过程中，刀刺向了墨言忱。墨言忱对曲媚儿彻底失望，回到墨府，他不想再参与皇权争斗中，墨父先是求他，而后又搬出墨言忱的母亲来压他，说这是替天行道，墨言忱下定决心帮助墨父夺权。
墨连城想救曲小檀出天牢，曲小檀却想留下来看看皇上到底要做什么。肖镇练成夺魂曲谱，皇上可以实施她的终极计划了。肖镇让曲小檀换上干净的衣服，曲小檀认识到自己要被杀头了，她就想办法拖延时间，肖镇知道她心思，就陪她聊最后一程。这时肖镇才发现曲小檀和皇上一模一样。
肖镇将曲小檀拉到镇魂珠跟前，用刀将她手划破，血液滴到镇魂珠上，瞬时间镇魂珠被唤醒，肖镇开始使唤法术，并吹起夺魂曲，曲小檀大骂皇上丧心病狂，非要拿肖镇的命做赌注，皇上不闻不顾，因为这么多年来她处心积虑就是为了这一刻。
皇上和曲小檀相继晕倒，肖镇吐血而忘。曲小檀醒来后，皇上的灵魂已经控制了她的躯体，她心中充满了对肖镇的愧疚。曲小檀回到东宫，墨连城连忙关心她，看到她手上的伤心疼不已。
皇上暴毙，传曲小檀进宫继位，曲媚儿感觉太突然，其中必有蹊跷，曲小檀则一反常态，还拿以前的丑事要挟她，曲媚儿心中产生狐疑。
墨连城询问过流百水后，告诉曲小檀荧惑守心很快就能出现，到时就可以见到煜儿了。曲小檀则不像之前那样兴奋了，墨连城也开始对她身份开始怀疑，便去大牢打探。墨连城来到皇上寝宫，发现了光尘，他突然明白了，皇上此刻已经寄宿在曲小檀体内，这也是肖镇死亡的原因。
墨连城将假曲小檀拉到满是镜子的房间，逼其承认是曲香檀，此时镜子里传出曲小檀呼喊着城城救救我的声音，曲香檀突然拿出刀放在脖子上，胁迫墨连城乖乖听话，否则就杀了曲小檀。
朝堂上曲小檀杀死那些反对自己的大臣，还让曲媚儿帮助自己对付墨家，她的这些变化，让曲媚儿有些害怕，只得照办。镜心听见曲小檀要对付墨家，便心急火燎去找墨连城，墨连城告诉她真相，还让她继续装作什么都不知道。
曲媚儿将对付墨府的计划向墨言忱和盘托出，墨言忱大吃一惊，没想到曲檀儿变成这样，曲媚儿告诉他曲檀儿早已不是曾经的那个曲檀儿了。墨连城让她保护好自己，如若因此丢了性命，他会愧疚，曲媚儿则说俩人已经清了，互不相欠。
于皓来墨府告密，墨父不相信，直到墨言忱来后，他才相信是真的，但他还幻想着鲁将军能主持公道。墨父先让墨靖轩离开墨府避难，又将墨言忱诱骗出府，这时禁卫军就抓着墨靖轩赶来了。
墨父为了保住墨府上下老小，果断自杀，可是禁卫军接到的命令是将墨府满门抄斩，除了墨靖轩。墨连城赶来后，墨府已经血流成河，看着奄奄一息的墨父他心痛不已。
曲媚儿知道自己被皇上利用后，希望她也将自己杀了吧！她背负不了杀死墨府一家的骂名，可是皇上认为她另有用处。墨言忱知道墨父被杀后，决心要替父报仇，杀了皇上，墨父之前的手下纷纷请战，听从墨言忱调遣。
皇上登基，墨言忱带兵来劫杀她，却发现中计，轿中并不是皇上，而是曲媚儿。墨言忱本想保护曲媚儿杀出重围，没想到阡陌和曲媚儿为保护他相继死去。皇上出现，墨言忱本想杀了她，却发现是曲檀儿，一时心软，被皇上杀死。
皇上登基，墨连城被控制并被封为后宫之主。墨连城看着昔日与曲小檀写下的保证书，伤心不已，皇上看见后不高兴，让他死了这条心吧，因为曲小檀已经死了。墨连城却认为二人不管在哪，都会心有灵犀，这时曲小檀有了回音，皇上大怒，将保证书撕碎。
墨连城让于皓负责找冰川草，镜心去找流百水帮忙。上元节到了，皇上带着墨连城看专属的烟花表演，墨连城要为皇上献上一段剑舞。此时于皓已经将侍卫迷晕，并闯入皇上寝宫。
皇上看着墨连城舞剑入了迷，可是当舞剑者取下面具后，她才发现墨连城已经逃跑了。便赶紧派兵追捕，先去了灵幽坛，墨连城先一步，已带着镇魂珠逃跑。
此时墨连城和墨靖轩、流百水来到了一个隐秘的地方，镇魂珠、冰川草、离魂箫都已到位，只等着三日后荧惑守心出现，墨连城吹响离魂箫，曲小檀便可以复活了，墨连城知道这样做会很危险，有可能像肖镇一样死去，但他不怕。
皇上病发，去吹离魂箫，却发现是假的，这时离魂箫响起，她顺着声音找去，见到墨连城。墨连城告诉她，他不是皇上爱着的连成公子，连成公子已经被曲香檀杀死。
此时荧惑守心出现，墨连城再次吹响离魂箫，皇上用剑指着墨连城的胸口，顿时想起曾经她杀死连成公子的一幕，难道这一幕要再次重演，这时她才发现自己错了，一直把墨连城当成了连成公子，随后便跳崖身亡。
墨连城和曲小檀重新回到当初的东岳，看到了煜儿，墨连城顿时心有愧，他想着以后要当个好父亲、好丈夫，更要当一个明君。随即废除女子三从四德，让男女平等，煜儿成了镇魂珠的宿主。
日子恢复平静，墨连城便和曲小檀商量生小公主的事情，并且还包揽换尿布等事情，墨连城和曲小檀幸福相拥，享受着他们三生三世的爱情。
